В Уфе больше всех пациентов лечится в клинике Башкирского государственного медицинского университета, на втором месте – республиканская клиническая больница им. Куватова, на третьем – городская клиническая больница №8. Инфицированные проходят лечение в республиканской клинической инфекционной больнице, клинических больницах №5, №13, №18, №19, №21, а также в республиканской клинической психиатрической больнице, в республиканском клиническом психиатрическом диспансере, республиканском кожно-венерологическом диспансере, клинической больнице Дёмского района. За пределами Уфы по количеству пациентов с коронавирусной инфекцией лидируют Нефтекамская городская больница и Белебеевская центральная районная больница.